A Igreja recomenda que a comunhão espiritual seja acompanhada de uma oração feita com fé, humildade e profundo amor a Cristo. Diversas fórmulas tradicionais foram propostas por santos e autores espirituais ao longo dos séculos, sendo a mais conhecida a oração composta por Santo Afonso Maria de Ligório:
“Meu Jesus, creio que estais realmente presente no Santíssimo Sacramento do altar. Amo-Vos sobre todas as coisas e desejo receber-Vos em minha alma. Já que agora não posso receber-Vos sacramentalmente, vinde ao menos espiritualmente ao meu coração. Uno-me inteiramente a Vós, como se já Vos tivesse recebido. Não permitais que jamais me separe de Vós. Amém.”
Essa oração expressa perfeitamente os elementos essenciais da comunhão espiritual: fé na presença real, desejo ardente de união e entrega confiante ao amor de Cristo. Ela é recomendada em diversos manuais espirituais e consta também no Enchiridion Indulgentiarum, como meio legítimo de união com Jesus Eucarístico .
Além dessa oração tradicional, muitos fiéis também recorrem a fórmulas mais breves, usadas em momentos de oração pessoal ou em situações de maior simplicidade. Uma versão piedosa, atribuída a São Josemaria Escrivá, é:
“Quisera, Senhor, receber-Vos com a mesma humildade e devoção com que Vos recebeu a vossa Santíssima Mãe, com o espírito e o fervor dos santos.”
